Bulletin de l'Organisation mondiale de la Santé

Estimation du taux de reproduction efficace de la rougeole en Australie à partir de données de notification de routine

May Chiew, Heather F Gidding, Aditi Dey, James Wood, Nicolee Martin, Stephanie Davis & Peter McIntyre

Objectif

Estimer le taux de reproduction efficace de la rougeole (R) en Australie en modélisant les données de notification de routine recueillies.

Méthodes

R a été estimé pour la période 2009-2011 à l'aide de 3 méthodes, en utilisant les données du Système de Surveillance des Maladies à Déclaration Obligatoire de l'Australie. La méthode 1 a estimé que R est égal à 1 – P, où P est égal à la proportion de cas importés, tels que déterminés à partir des données obtenues sur le lieu de l'acquisition. Les autres méthodes ont estimé R en ajustant un processus de ramification sous-critique qui modélise la propagation d'une infection avec un R donné pour les distributions observées de l'ampleur de l'épidémie (méthode 2) et des générations de la propagation (méthode 3). Le logiciel Stata version 12 a été utilisé pour la méthode 2, et la logiciel Matlab version R2012 pour la méthode 3. Pour toutes les méthodes, le calcul des intervalles de confiance à 95% (IC) a été effectué en utilisant une approximation normale basée sur les erreurs type estimées.

Résultats

Au cours de la période 2009-2011, 367 cas de rougeole à déclaration obligatoire ont été enregistrés en Australie (taux moyen annuel: 5,5 cas par million d'habitants). Les données étaient complètes à 100% pour le statut de l'importation, mais complètes à seulement 77% pour le numéro de référence de l'épidémie. R a été estimé comme étant < 1 pour toutes les années et tous les types de données, avec des valeurs de 0,65 (IC à 95%: 0,60-0,70) obtenues par la méthode 1, avec des valeurs de 0,64 (IC à 95%: 0,56–0,72) par la méthode 2 et avec des valeurs de 0,47 (IC à 95%: 0,38–0,57) par la méthode 3.

Conclusion

Le fait que des estimations cohérentes de R ont été obtenues à partir de ces 3 méthodes renforce la confiance dans la validité de ces méthodes pour la détermination de R.

Partager