Новости о вспышках болезней

Вариантный штамм вируса SARS-CoV-2, ассоциированный с норкой – Дания - Великобритания и Северная Ирландия

21 декабря 2020 г.

Краткая сводка

14 декабря 2020 г. власти Соединенного Королевства Великобритании и Северной Ирландии сообщили ВОЗ о выявлении методом геномного секвенирования нового варианта вируса SARS-CoV-2. Новому варианту вируса было присвоено обозначение SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (Variant Under Investigation («изучаемый вариант»), год 2020, месяц 12, вариант 01).

Подробные данные о событии

14 декабря 2020 г. власти Соединенного Королевства Великобритании и Северной Ирландии сообщили ВОЗ о выявлении методом геномного секвенирования нового варианта вируса SARS-CoV-2. Новому варианту вируса было присвоено обозначение SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (Variant Under Investigation («изучаемый вариант»), год 2020, месяц 12, вариант 01). Предварительные результаты анализа указывают на потенциальную способность нового варианта легче передаваться от человека к человеку. В настоящее время ведутся исследования, которые позволят установить наличие возможных изменений в тяжести симптомов, реакции антителообразования или эффективности вакцин в связи с данным вариантом коронавируса.

По состоянию на 13 декабря 2020 г. в Великобритании было выявлено в общей сложности 1108 случаев заражения вирусом SARS-CoV-2 VUI 202012/01. Этот вариант вируса был выявлен в рамках начатого в декабре 2020 г. эпидемиологического и вирусологического расследования неожиданного роста числа случаев COVID-19 в Юго-Восточной Англии. Этот рост выражался в более чем трехкратном увеличении 14-дневного числа выявленных случаев инфекции в период с 41-й до 50-ю неделю (с 5 октября по 13 декабря 2020 г.). В среднем с начала пандемии в Великобритании регулярно секвенируется от 5 до 10% всех образцов вируса SARS-CoV-2. В Юго-Восточной Англии этот показатель составляет 4%. С 5 октября по 13 декабря 2020 г. более 50% секвенированных изолятов в Юго-Восточной Англии были идентифицированы как вариантный штамм. Ретроспективный анализ позволил установить место и дату первого появления этого варианта – Кент, Юго-Восточная Англия, 20 сентября 2020 г. После этого вариант начал быстро распространяться вплоть до его обнаружения в ноябре 2020 г. Большинство больных COVID-19, у которых был обнаружен этот вариант коронавируса, – лица моложе 60 лет.

Для этого варианта характерно наличие 14 аминокислотных замен и трех делеций. Некоторые из этих мутаций могут влиять на контагиозность вируса в человеческой популяции:

  • одна из мутаций (N501Y) заключается в замене одного из шести аминокислотных остатков в рецептор-связывающем домене. В базе данных Глобальной инициативы по обмену данными о птичьем гриппе (GISAID) есть информация о независимом обнаружении аналогичной мутации в рецептор-связывающем домене (N501Y) в нескольких странах, включая Южную Африку (n=45) и Австралию (n=37). Данные геномного секвенирования позволили установить, что между выявленными в Великобритании и Южной Африке вариантами с мутацией N501Y связь отсутствует.
  • В рецептор-связывающем домене выявлена еще одна мутация, представляющая биологический интерес, – P681H.
  • Наконец, у нового варианта была обнаружена делеция в позиции 69/70, что может снизить эффективность некоторых ПЦР-тестов, использующих в качестве мишени ген, кодирующий белок S. Большинство применяемых в мире ПЦР-тестов используют сразу несколько мишеней, поэтому значительного снижения эффективности диагностики коронавирусной инфекции в связи с появлением этого варианта вируса не ожидается.

Новый вариант вируса VUI-202012/01 был обнаружен в нескольких странах, включая Австралию, Данию, Италию, Исландию и Нидерланды.

По предварительным данным британских экспертов этот вариант отличается большей контагиозностью по сравнению с другими циркулирующими вариантами. По оценкам, его способность к передаче от человека к человеку увеличена на 40%-70% (что означает увеличение на 0,4 базового репродуктивного числа R0 до 1,5-1,7). В настоящее время ведутся лабораторные исследования, которые позволят установить, обладает ли новый вариант вируса новыми биологическими свойствами и будет ли он оказывать влияние на эффективность вакцин. Имеющаяся на данный момент информация не позволяет с уверенностью судить о том, связаны ли с новым вариантом вируса какие-либо изменения в тяжести клинического течения болезни, реакции антителообразования и эффективности вакцин. 

Противоэпидемические мероприятия

Власти Великобритании проводят эпидемиологические и вирусологические исследования с целью дальнейшей оценки контагиозности нового варианта, тяжести вызываемой им инфекции, риска повторной инфекции и вызываемой им реакции антителообразования. Поскольку одна из мутаций (N501Y) имеет место в рецептор-связывающем домене, органы здравоохранения в срочном порядке ведут изучение нейтрализующей активности сыворотки выздоровевших и вакцинированных пациентов в отношении этого варианта вируса, что позволит оценить его потенциальное воздействие на эффективность вакцин.

Данные о геноме этого варианта вируса были загружены властями Великобритании в систему GISAID. По всей территории страны продолжается наблюдение за ситуацией и ведется эпидемиологический надзор с выполнением геномного секвенирования.

19 декабря 2020 г. власти Великобритании объявили о том, что в отношении инфицированных районов будут введены ограничительные меры 4 уровня (наиболее высокий уровень), включая ограничения на собрания, ужесточение ограничений на передвижение людей, по возможности переход на дистанционную занятость и прекращение работы предприятий, чья деятельность не является жизненно необходимой для общества. 

Оценка риска ВОЗ

Все вирусы, включая SARS-CoV-2, с течением времени изменяются, однако большинство этих мутаций или изменений не дает вирусам непосредственных преимуществ, а иногда может приводить даже к снижению их распространения. Для более полного понимания влияния конкретной мутации на свойства вируса и эффективность средств диагностики, лекарственных средств и вакцин требуются дальнейшие лабораторные исследования. Эти исследования являются сложными и требуют времени и сотрудничества между различными коллективами ученых.

Обмен полными геномными последовательностями вируса облегчает его подробное изучение партнерами. Рабочая группа ВОЗ по изучению эволюции вируса SARS-CoV-2 оказывает содействие британским коллегам в анализе имеющихся данных и подготовке дальнейших исследований.

Для изучения влияния нового варианта вируса на клиническую картину заболевания, его диагностику, лечение и процесс создания вакцин против SARS-CoV-2 требуется скорейшее проведение дальнейших эпидемиологических и лабораторных исследований.

Рекомендации ВОЗ

Предварительные данные, поступившие из Великобритании, поднимают более широкий вопрос о проблеме мутации вируса SARS-CoV-2, и в этой связи ВОЗ подчеркивает важность оперативного обмена эпидемиологическими и вирусологическими данными и данными полногеномного секвенирования с другими странами и исследовательскими группами, в том числе посредством таких открытых платформ, как GISAID и другие.

ВОЗ рекомендует вести дальнейшие эпидемиологические и вирусологические исследования для изучения мутаций, обнаруженных в Великобритании и других странах, с целью выявления возможных изменений свойств вируса в том, что касается его инфекционности и патогенности. ВОЗ рекомендует всем странам, по возможности, на регулярной основе выполнять геномное секвенирование вариантов вируса SARS-CoV-2 и предоставлять данные геномного секвенирования другим странам, в частности в случае обнаружения аналогичных потенциально опасных мутаций.

ВОЗ обращает особое внимание на сообщения о предполагаемом снижении эффективности ПЦР-тестов, в качестве мишени использующих ген вируса, кодирующий белок S. Лабораториям, закупающим ПЦР-комплектами, в инструкции по использованию которых производителем не указана точная информация о вирусных генах-мишенях, рекомендуется обратиться к производителю для получения дополнительной информации. Лаборатории, использующие собственные ПЦР-тесты, мишенью которых является белок S вируса, также должны учитывать проблему возможного снижения чувствительности тестов. Для предупреждения негативного воздействия на возможности стран по выявлению вируса ВОЗ также рекомендует параллельное использование нескольких тест-систем или мультиплексных тестов, в которых мишенями являются несколько вирусных генов, что позволит обеспечить выявление новых вариантов вируса в случае их возникновения.

Всем странам необходимо выполнять оценку уровня распространения инфекции на местном уровне и проводить соответствующие контрольно-профилактические мероприятия, в том числе адаптируя действующие противоэпидемические ограничения в соответствии с рекомендациями ВОЗ.

Важно регулярно напоминать населению и работникам здравоохранения о базовых мерах профилактики острых респираторных инфекций:

  • исключение тесных контактов с лицами, страдающими острыми респираторными инфекциями;
  • частое мытье рук, особенно после непосредственного контакта с больными или предметами окружающей их обстановки;
  • соблюдение лицами с симптомами острых респираторных инфекций респираторного этикета (физическое дистанцирование, прикрывание носа и рта одноразовыми салфетками или предметами одежды при кашле и чихании и мытье рук);
  • усиление стандартных мер профилактики инфекций и инфекционного контроля в медицинских учреждениях, особенно в отделениях неотложной помощи;
  • ношение масок в местах, где оно является необходимым, и регулярное проветривание помещений.

ВОЗ рекомендует соблюдение всех приведенных выше мер профилактики всеми лицами, совершающими международные поездки, в том числе в/из Великобритании. При появлении во время или после поездки симптомов, указывающих на респираторное заболевание, рекомендуется обратиться за медицинской помощью и сообщить медицинскому специалисту о посещенных местах. Органам здравоохранения следует взаимодействовать с организациями сферы путешествий, туризма и транспорта для распространения среди лиц, совершающих поездки, общей информации о способах уменьшения риска острых респираторных инфекций по таким каналам, как медицинские учреждения, обслуживающие туристов, туристические бюро, операторы пассажирских перевозок и пункты пропуска через государственную границу.

В соответствии с рекомендациями Комитета по чрезвычайной ситуации в связи с COVID-19, сформулированными на его последнем совещании, ВОЗ рекомендует государствам-участникам ММСП регулярно пересматривать ограничительные меры, действующие в отношении международных поездок, в соответствии со статьей 43 ММСП (2005 г.), и продолжать предоставлять ВОЗ информацию и научное обоснование мер, существенно ограничивающих международное сообщение. Принимаемые странами меры, ограничивающие международные перевозки, должны быть основаны на результатах анализа факторов риска и научных данных, а также являться последовательными, соразмерными и ограниченными по времени.

В недавно опубликованных ВОЗ временных рекомендациях "Considerations for implementing a risk-based approach to international travel in the context of COVID-19", («Некоторые аспекты принятия мер в отношении международных перевозок в контексте COVID-19 на основе анализа рисков») изложены принципы учета рисков при принятии противоэпидемических мер в отношении международного сообщения, что позволит сократить связанные с международными перевозками завоз и последующее распространение вируса SARS-CoV-2, исключая при этом введение чрезмерных ограничений международного сообщения.

ВОЗ рекомендует странам руководствоваться в своих решениях анализом риска. Национальным органам власти настоятельно рекомендуется публиковать применяемые ими методы оценки риска и список стран, в отношении сообщения с которыми действуют ограничения; эти списки должны регулярно обновляться. При любых обстоятельствах странам следует оказывать содействие приоритетным видам пассажирских и грузовых перевозок (например, поездкам лиц, участвующих в реагировании на чрезвычайные ситуации, лиц, оказывающих техническую поддержку в сфере здравоохранения, важнейших категорий персонала транспортного сектора и сектора безопасности, например моряков; перевозкам в рамках репатриации; перевозкам важнейших предметов снабжения, таких как продовольствие, медикаменты и топливо).

Дополнительная информация о COVID-19: