Suivi des variants du SARS-CoV-2

Tous les virus, y compris le SARS-CoV-2, le virus responsable de la COVID-19, mutent avec le temps. La plupart des mutations n’ont que peu ou pas d’incidence sur les propriétés du virus. Cependant, certaines mutations peuvent affecter les propriétés du virus et influer, par exemple, sur la facilité avec laquelle il se propage, la gravité de la maladie qu’il entraîne ou l’efficacité des vaccins, des médicaments, des outils de diagnostic ou des autres mesures sociales et de santé publique.

Le groupe de travail de l’OMS sur l’évolution du virus a été créé en juin 2020 afin d’examiner spécifiquement les variants du SARS-CoV-2, leur phénotype et leurs répercussions sur les mesures de lutte. Il a pris ensuite le nom de Groupe consultatif technique sur l'évolution du virus SARS-CoV-2 (en anglais). L’apparition, fin 2020, de variants qui présentaient un risque accru pour la santé publique mondiale a conduit l’OMS à caractériser certains d’eux comme des variants à suivre et d’autres comme des variants préoccupants, afin de hiérarchiser les activités de surveillance et de recherche au niveau mondial et de guider la riposte à la pandémie de COVID-19. Depuis mai 2021, l’OMS attribue aux principaux variants des dénominations simples, faciles à prononcer.

Des progrès considérables ont été accomplis dans la mise en place puis le renforcement d’un système mondial pour détecter les signes d’éventuels variants à suivre ou variants préoccupants et pour évaluer rapidement le risque que les variants du SARS-CoV-2 présentent pour la santé publique. Plus précisément, en 2024, l’OMS a lancé CoViNet, un réseau consacré aux coronavirus (en anglais), dans le but de faciliter la détection rapide et précise des coronavirus et le suivi des variants, ainsi que de coordonner l’évaluation des risques. Il demeure essentiel de maintenir ces systèmes et de partager les données, conformément aux principes de bonne pratique et en temps utile, car les niveaux de circulation du virus restent élevés partout dans le monde. Tout en surveillant la circulation du SARS-CoV-2 à l’échelle mondiale, il reste aussi indispensable de surveiller sa propagation au sein des populations animales et les individus chroniquement infectés, autant d'aspects cruciaux de la stratégie mondiale visant à limiter l’apparition de mutations qui ont des répercussions négatives sur la santé publique. En mars 2023, l’OMS a mis à jour son système de suivi et ses définitions de travail pour les variants préoccupants, les variants à suivre et les variants sous surveillance. Ces informations sont disponibles ici (en anglais). Les définitions de travail précédentes peuvent être consultées ici (en anglais).

Variants préoccupants (VOC) actuellement en circulation : mise à jour du 15 mars 2023

Note : Pour mieux rendre compte de la situation actuelle des variants, caractérisée par la prédominance des lignées descendantes d’Omicron, l’OMS a mis à jour son système de suivi des variants préoccupants (VOC) et des variants à suivre (VOI) du SARS-CoV-2 le 15 mars 2023.

Variants à suivre (VOI) actuellement en circulation : mise à jour du 28 juin 2024

 

Lignée PANGOClade NextstrainCaractéristiques génétiquesPremiers échantillons répertoriésDate de désignation et évaluation des risques

BA.2.86$

23I

Mutations relatives à BA.2 (en anglais)

24/07/2023

21/11/2023

Évaluation initiale du risque lié à BA.2.86, 21 novembre 2023 (en anglais)

JN.1#

24A

BA.2.86 + S:L455S

25/08/2023

18/12/2023

Évaluation initiale du risque pour JN.1, 18 décembre 2023 (en anglais)

Mise à jour de l'évaluation initiale du risque pour JN.1, 9 février 2024 (en anglais)

Mise à jour de l’évaluation du risque lié à JN.1, 15 avril 2024 (en anglais)

 

$ Exclut les sous-lignées de BA.2.86 répertoriées ici comme variants à suivre.

# Exclut les sous-lignées de JN.1 répertoriées ci-dessous comme variants sous surveillance.

Variants sous surveillance (VUM) actuellement en circulation : mise à jour du 24 septembre 2024

Lignée PANGOClade NextstrainCaractéristiques génétiquesPremiers échantillons répertoriésDate de désignation

JN.1.7

24A

JN.1 + S:T572I, S:E1150D

25/09/2023

03/05/2024

KP.2

24B

JN.1 + S:R346T, S:F456L, S:V1104L

02/01/2024

03/05/2024

KP.3

24C

JN.1 + S:F456L, S:Q493E, S:V1104L

11/02/2024

03/05/2024

KP.3.1.1

24C

KP.3 + S:S31-

27/03/2024

19/07/2024

JN.1.18

24A

JN.1 + S:R346T

02/11/2023

03/05/2024

LB.1

24A

JN.1 + S:S31-, S:Q183H, S:R346T, S:F456L

26/02/2024

28/06/2024

XEC JN.1 + S:T22N, S:F59S, S:F456L, S:Q493E, S:V1104L
16/05/2024 24/09/2024